《修学旅行时被分进了合不来的组》讲述了一群高中生在修学旅行期间被随机分组，主角意外地与性格迥异、彼此不合的同学们在一个小组，展开了一段充满冲突与成长的故事。影片背景设定在风景秀丽的京都，传统与现代交织的环境为剧情增添了独特的文化氛围。

故事围绕主角真司，一个性格内向且喜欢独处的学生展开。他被分入包括活泼外向的彩乃、爱说教的学霸拓海，以及沉默寡言但观察力敏锐的美咲的组里。初期，组内成员因性格差异频频摩擦，导致团队活动屡屡失败。从观光景点迷路、合作游戏的失误，到意见分歧引发的激烈争吵，种种矛盾将他们推向了崩溃边缘。

然而，随着故事发展，几次意外事件让他们逐渐理解彼此的内心世界，例如夜晚的谈心、分组挑战中的互相扶持。影片高潮部分，组员们共同面对一次突发的自然灾害，迫使他们放下成见，紧密合作。最终，这段经历不仅让他们完成了修学旅行的任务，更在情感上建立了深厚的友情。影片以他们在京都塔下合影留念，笑容绽放的画面温馨收尾，寓意着成长与和解。